医学中真空技术主要用于医疗器械和药物生产中。这些新型医疗设备的有效利用将有助于外科手术的成功，有效地延长药品、疫苗、血液的使用期和增加使用效果。六十年代以来，真空技术又应用于高速离心机、电子显微镜和X射线管等处。
临床上的真空抽吸:临床抽吸在外科中经常见到。小型拍吸主要用于针管抽吸。在一般情况下主要抽吸患者手术之后的淤血、脓液、呕吐物、腹水和痰等。显然这些必须采用连续的抽吸方法，同时还要防止细菌的侵入，也就是应当保证严格的无菌操作。
在五官科及胸外科手术之后，常常采用一种微型机械泵抽除患者喉部的积痰。但是对于淤血、脓液、唯吐物、腹水的抽除还必须有一套抽吸装置。常采用的有水喷射器、水蒸汽喷射泵、水环泵、滑阀式机械泵、旋片式机械泵和罗茨泵。
使用真空抽吸器时，对真空管线的安装有一定的要求，因为随着泵的启动，将很快地对患者产生影响。在大医院所用的真空抽吸器的真空抽吸系统可用一个真空泵进行工作，而同时对许多患者进行临床抽吸治疗。但各引液管应装有压力和流量控制，放全堵头和细菌过滤器，同时还可以从音响和直观看出真空的好坏程度。这种装置适用于大型外科病房，避免了分别使用真空泵而造成的噪声，合理的提高了真空泵的利用率。但是采用这种真空抽吸系统，管路要合理安装并避免真空管线的细菌污染。
对于真空抽吸器，尽管所要求达到的最低压强仪为50Torr，考虑到管路走线较长，流导减少，系统漏气等不利因素，可使其平均抽速尽可能地大一些。具体进行操作时可由压力调节装置来选择合适的真空条件和抽吸时流量的大小。如发现漏气，能及时堵漏。
在具体进行操作时，要注意抽速的大小。系统的设计抽速与实际抽速是不相同的，因为设计抽速是对空气而言的，而实际则是抽吸的脓血、痰这一类粘性大的液体，由抽吸时的流量调节可以定出抽吸液的流量，从而可以估算出系统的实际抽速。
